bet9九州登录入口,bet9九州最新官网

刘喜朋

副教授

  • 电话:+86-021-34204378
  • 邮箱:xpliu@sjtu.edu.cn
  • 地址:生物药学楼3号楼207

学术经历

  • 1、受教育经历
  • 2001/03-2005/06,bet9九州登录入口,生命科学与技术学院,博士学位,导师 刘建华教授。
  • 1998/09-2001/02,天津大学,化工学院生物化工系,硕士学位,导师 元英进教授。
  • 1994/09-1998/07,天津大学,化工学院生物化工系,学士学位,导师 元英进教授。
  • 2、工作经历
  • 2010/06 –今 bet9九州登录入口,bet9九州登录入口,微生物代谢国家重点实验室,副教授。
  • 2008/12 – 2010/05,法国国家科学研究中心分子遗传研究所(CNRS, Centre de Genetique Moleculaire),博士后。
  • 2008/01 – 2008/11,bet9九州登录入口,bet9九州登录入口,副教授。
  • 2005/07 – 2007/12,bet9九州登录入口,bet9九州登录入口,讲师。

研究方向

1. 极端微生物DNA复制与损伤修复

1)DNA replisome(复制体)的组装、动态变化、调控及其在核酸扩增中的应用。

2)同源重组修复、非同源末端连接修复、核苷酸切除修复、碱基切除修复的分子机制及其在基因组编辑技术中的应用。

3)CRISPR分子机制及其蛋白在基因编辑、分子诊断中的应用。

2.核酸代谢与癌症、分子诊断应用

1)DNA复制与损伤修复缺陷与癌症易感性之间的关联机制。

2)核酸检测、SNP基因分型、分子诊断与基因编辑技术开发,及其在精准用药、癌症早期诊断、遗传病与传染病检测、法医刑侦、食品致病微生物、宠物疾病检测中的应用。
 

3.极端微生物基因资源挖掘利用

1)极端微生物重要功能基因的挖掘利用,尤其有重要经济价值的极端酶。
2)高通量基因克隆、蛋白表达纯化高通量筛选、重组蛋白表达工艺优化。

代表论著

  • ?  

    Feng L#, Chang CC#, Song D, Jiang C, Song Y, Wang CF, Deng W, Zou YJ, Chen HF, Xiao X, Wang FP, Liu XP*. (2018) The trimeric Hef-associated nuclease HAN is a 3'→5' exonuclease and is probably involved in DNA repair, Nucleic Acids Res. 46(17): 9027–9043.

    ?  

    Li MJ, Yi GS, Yu F, Zhou H, Chen JN, Xu CY, Wang FP, Xiao X, He JH*, Liu XP*. (2017) The crystal structure of Pyrococcus furiosus RecJ implicates it as an ancestor of eukaryotic Cdc45, Nucleic Acids Res. 45(21): 12551-12564.

    ?  

    Yuan H#, Liu XP #,*, Han Z, Allers T, Hou JL, Liu JH*. (2013) RecJ-like protein from Pyrococcus furiosus has 3’-5’ exonuclease activity on RNA: implication of its proofreading capacity on 3’-mismatched RNA primer in DNA replication, Nucleic Acids Res. 41(11): 5817-5826.

    ?  

    Deng YJ, Feng L, Zhou H, Xiao X, Wang FP, Liu XP*. (2018) NanoRNase from Aeropyrum pernix shows nuclease activity on ssDNA and ssRNA, DNA Repair 65(1): 54–63.

    ?  

    Xie JJ#, Liu XP#,*, Han Z, Yuan H, Wang Y, Hou JL, Liu JH*. (2013) Chlamydophila pneumoniae endonuclease IV prefers to remove mismatched 3' ribonucleotides: Implication in proofreading mismatched 3'-terminal nucleotides in short-patch repair synthesis, DNA Repair 12(2): 140-147.

获奖情况

  • 1)bet9九州登录入口晨星青年学者奖励计划二等奖。
  • 2)全国大学生生命科学创新创业大赛指导教师一等奖。

教学情况

  • 生物化学(F),48学时,本科生,主讲教师。
  • 高级生化实验,32学时,本科生,共同主讲教师。
  • 1)国家自然科学基金联合基金项目,U1832161,决定古菌DHH家族磷酸酯水解酶底物特异性的结构研究,2019年1月-2021年12月,54万,在研,主持。
  • 2)国家重点研发计划“深海关键技术与装备”重点专项,2018YFC0310700,深海热液区生物资源研究与应用评价,2018年7月-2021年12月,65万,在研,子课题负责人。
  • 3)国家重点研发计划“深海关键技术与装备”重点专项,2018YFC0309800,海斗深渊环境特征与生命演化工程,2018年7月-2021年12月,75万,在研,子课题负责人。
  • 4)国家自然科学基金面上项目,31371260,古菌RecJ-like核酸酶参与校正RNA引物3'末端错配核糖核苷酸的分子机制研究,2014年1月-2017年12月,80万,已结题,主持。
  • 5)上海市自然科学基金,12ZR1413700,古菌A. pernix dU损伤碱基切除修复的生化研究,2012年7月-2015年6月,10万,已结题,主持。
  • 6)国家自然科学基金青年基金项目,30700131,基于耐高温mutS蛋白、pfu DNA聚合酶、dU修饰寡核苷酸探针的SNP检测技术,2008年1月-2010年12月,17万,已结题,主持。

承担项目

学生培养

  • 在读学生
  • 毕业学生